приведенным в таблице 29. На основании полученных спектров отмечали наличие или отсутствие того или иного фрагмента и вычисляли частоты встречаемости каждого и размерных фрагментов.
Используя те же принципы и методики, которые использовались при амплификации (AG)9С-PCR-маркеров, были амплифицированы (GA)9С-PCRмаркеры и получены спектры фрагментов (рис. 10).
Здесь так же можно отметить наиболее часто встречаемые фрагменты характерные для большинства животных. Такие фрагменты могут являться показателями видовой принадлежности. Так же были выявлены дополнительные полосы в спектре, характеризующие генетическое разнообразие.
В целом по двум праймерам выявлено 72 размерных фрагмента ДНК (36 фрагментов по (AG)9С и 36 – по (GA)9C) (таблица 29, рис. 11, 12).
Частоты встречаемости ISSR-фрагментов варьировали в популяции романовских овец.
Наиболее высокую частоту встречаемости AG-ISSR ампликонов были выявлены у шести фрагментов (А13=1060-1000п.н. – 0,335135; А20=680-640п.н. – 0,324324; А21=640-680 п.н. – 0,362162; А24=530-560 п.н. – 0,351351; А25=400-470 п.н. – 0,345946; А27=440-410 п.н.- 0,340541), встречающиеся у особей изученной популяции.
С помощью праймера (GA)9C обнаружены четыре фрагмента, имеющих значительную частоту встречаемости (G3=2000-1800 п.н. – 0,400000; G8=14001300 п.н. – 0,475676; G24=530-500 п.н. – 0,632432; G25= 400-470 п.н. – 0,405405).
Таблица 29- Частоты встречаемости фрагментов, полученных с помощью праймеров (AG)9С и (GA)9C
| Фрагменты | ИРФ | Частота встречаемости | Фрагменты | ИРФ | Частота встречаемости |
|---|---|---|---|---|---|
| A1 | 2500-2300 | 0,059459 | G1 | 2500-2300 | - |
| A2 | 2300-2000 | 0,059459 | G2 | 2300-2000 | 0,054054 |
| A3 | 2000-1800 | 0,010811 | G3 | 2000-1800 | 0,400000 |
| A4 | 1800-1700 | 0,064865 | G4 | 1800-1700 | 0,210811 |
| A5 | 1700-1600 | 0,124324 | G5 | 1700-1600 | 0,172973 |
| A6 | 1600-1500 | 0,259459 | G6 | 1600-1500 | 0,189189 |
| A7 | 1500-1400 | 0,210811 | G7 | 1500-1400 | 0,091892 |
| A8 | 1400-1300 | 0,048649 | G8 | 1400-1300 | 0,475676 |
| A9 | 1300-1240 | 0,162162 | G9 | 1300-1240 | 0,124324 |
| A10 | 1240-1180 | 0,194595 | G10 | 1240-1180 | 0,016216 |
| A11 | 1180-1120 | 0,108108 | G11 | 1180-1120 | 0,081081 |
| A12 | 1120-1060 | 0,151351 | G12 | 1120-1060 | 0,064865 |
| A13 | 1060-1000 | 0,335135 | G13 | 1060-1000 | 0,124324 |
| A14 | 1000-940 | 0,183784 | G14 | 1000-940 | 0,032432 |
| A15 | 940-880 | 0,172973 | G15 | 940-880 | 0,059459 |
| A16 | 880-820 | 0,237838 | G16 | 880-820 | 0,102703 |
| A17 | 820-760 | 0,297297 | G17 | 820-760 | 0,081081 |
| A18 | 760-720 | 0,140541 | G18 | 760-720 | 0,124324 |
| A19 | 720-680 | 0,059459 | G19 | 720-680 | 0,059459 |
| A20 | 680-640 | 0,324324 | G20 | 680-640 | 0,054054 |
| A21 | 640-600 | 0,362162 | G21 | 640-600 | 0,048649 |
| A22 | 600-560 | 0,227027 | G22 | 600-560 | 0,043243 |
| A23 | 560-530 | 0,129730 | G23 | 560-530 | 0,243243 |
| A24 | 530-500 | 0,351351 | G24 | 530-500 | 0,632432 |
| A25 | 400-470 | 0,345946 | G25 | 400-470 | 0,405405 |
| A26 | 470-440 | 0,243243 | G26 | 470-440 | 0,383784 |
| A27 | 440-410 | 0,340541 | G27 | 440-410 | 0,059459 |
| A28 | 410-380 | 0,237838 | G28 | 410-380 | 0,027027 |
| A29 | 380-360 | 0,070270 | G29 | 380-360 | 0,216216 |
| A30 | 360-340 | 0,070270 | G30 | 360-340 | 0,054054 |
| A31 | 340-320 | 0,081081 | G31 | 340-320 | 0,113514 |
| A32 | 320-300 | 0,091892 | G32 | 320-300 | 0,167568 |
| A33 | 300-280 | 0,048649 | G33 | 300-280 | 0,037838 |
| A34 | 280-260 | 0,016216 | G34 | 280-260 | 0,043243 |
| A35 | 260-240 | 0,005405 | G35 | 260-240 | 0,227027 |
| A36 | 240-220 | - | G36 | 240-220 | 0,010811 |
| A37 | 220-200 | - | G37 | 220-200 | 0,005405 |
| A38 | 200-160 | 0,059459 | G38 | 200-160 | - |
На рисунках 11 и 12 приведены гистограммы распределения частот фрагментов по маркерам (AG)9С-PCR и (GA)9С-PCR соответственно.
0,4
0,35
0,3
0,25
0,2
0,15
0,1
0,05
0
A1 A3 A5 A7 A9 A11 A13 A15 A17 A19 A21 A23 A25 A27 A29 A31 A33 A35 A37
Фрагменты
Рисунок 11 - Частоты встречаемости фрагментов, полученных
с помощью олигонуклеотида (AG)9С
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
G1 G3 G5 G7 G9 G11 G13 G15 G17 G19 G21 G23 G25 G27 G29 G31 G33 G35 G37
Фрагменты
Частота встречаемости
Частота встречаемости
Рисунок 12 - Частоты встречаемости фрагментов, полученных с помощью олигонуклеотида (GA)9C
