0,4
0,35
0,3
0,25
0,2
0,15
0,1
0,05
0
A1 A3 A5 A7 A9 A11 A13 A15 A17 A19 A21 A23 A25 A27 A29 A31 A33 A35 A37
Фрагменты
Рисунок 11 - Частоты встречаемости фрагментов, полученных
с помощью олигонуклеотида (AG)9С
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
G1 G3 G5 G7 G9 G11 G13 G15 G17 G19 G21 G23 G25 G27 G29 G31 G33 G35 G37
Фрагменты
Частота встречаемости
Частота встречаемости
Рисунок 12 - Частоты встречаемости фрагментов, полученных с помощью олигонуклеотида (GA)9C
В таблицах 30 и 31 представлены оценки генетического разнообразия у исследованных популяций романовской породы овец. Показатели индекса Шеннона показывают генетическое разнообразие и могут свидетельствовать об отсутствии инбредной депрессии в популяции или ее жёсткой изоляции (Столповский Ю.А. и др., 2010). Анализируя полученные данные видно, что генетическое разнообразие, выявленное по индексу Шеннона с использованием олигонуклеотидов (AG) 9 C и (GA) 9 C составляет 0,239±0,003 и 0,214±0,003, соответственно. На основании полученных результатов можно сделать вывод о том, что данная микропопуляция относительно благополучна по выявленному внутрипопуляционному генетическому разнообразию.
Таблица 30- Параметры генетического разнообразия популяций романовской породы овец с использованием AG-ISSR-PCR маркеров
| Выборка | Средний на локус | Мера | Среднее число | Доля редких |
|---|---|---|---|---|
| индекс информации Шеннона, I (Lewontin, 1972) (±se) | информационного полиморфизма (PIC) | аллелей µ (Животовский, 1991) (±sµ) | аллелей hµ (Животовский, 1991) (±sh) | |
| 185 | 0,239±0,003 | 0,233±0,004 | 1,622±0,051 | 0,923±0,017 |
Обозначения: se – стандартная ошибка; sµ – ошибка среднего числа аллелей; sh – ошибка доли редких аллелей.
Таблица 31 - Параметры генетического разнообразия популяций романовской породы овец с использованием GA-ISSR-PCR маркеров
| Выборка | Средний на | Мера | Среднее число | Доля редких |
|---|---|---|---|---|
| локус индекс | информационног | аллелей µ | аллелей hµ | |
| информации | о полиморфизма | (Животовский, | (Животовский, | |
| Шеннона, I (Lewontin, 1972) (±se) | (PIC) | 1991) (±sµ) | 1991) (±sh) | |
| 185 | 0,214±0,003 | 0,201±0,004 | 1,583±0,054 | 0,929±0,016 |
Обозначения: se – стандартная ошибка; sµ – ошибка среднего числа аллелей; sh – ошибка доли редких аллелей.
Внутрипопуляционное разнообразие проанализировано также с помощью параметров среднего числа аллелей µ и доли редких аллелей hµ (Животовский Л.А., 1980; 1991). Среднее число аллелей µ оценивает степень разнообразия,
доля редких аллелей hµ оценивает структуру распределения частот фрагментов в популяции. Также они способны оценивать незначительные различия между популяциями по разнообразию. Наиболее это заметно при варьировании редких аллелей между популяциями.
Показатели среднего числа аллелей µ по праймерам (AG) 9 C и (GA) 9 C равны 1,622±0,051 и 1,583±0,054, соответственно, что говорит значительном разнообразии в исследуемой популяции. Так как их значение больше 1, следовательно, в популяции имеется неравномерное распределении числа аллелей.
Высокие значения hµ говорят о значительной неравномерности распределения частот фрагментов в популяции. Эти показатели соответствуют 0,923±0,017 и 0,929±0,016, поэтому можно говорить о том, что некоторые особи являются носителями значительной доли разнообразия. Таким образом, влияют на структуру популяции в целом, указывает на неравномерное распределение частот фрагментов.
Мера, или величина, информационного полиморфизма (PIC) определяется способностью маркера устанавливать полиморфизм популяции в зависимости от числа обнаруживаемых аллелей и распределения их частот (Botstein D. et all, 1980). Таким образом, PIC выявляет дискриминационную способность маркера, фактически зависит от числа устанавливаемых аллелей и распределения их частот и тем самым эквивалентна генному разнообразию. Для доминантных маркеров максимальное значение PIC составляет 0,5 (Чесноков Ю.В. и др, 2015).
Мера информационного полиморфизма (PIC) по праймерам (AG) 9 C и (GA) 9 C представлена показателями 0,233±0,004 и 0,201±0,004, соответственно. Это говорит о том, что популяция имеет умеренное генетическое разнообразие.
Таблицы 32, 33 и рисунки 13-23 характеризуют частоты встречаемости фрагментов и их распределение в разрезе линий, полученных с помощью праймера (AG) 9 С и (GA) 9 C.
В линии 8222 Rebel относительно высокая частота встречаемости по праймеру (AG) 9 С наблюдается у фрагментов А21 (0,404255) и А25 (0,425532), по праймеру (GA) 9 C – G2 (0,404255), G7 (0,489362), G23 (0,680851).
Низкие показатели частоты встречаемости представлены фрагментами А1 (0,042553), А8 (0,042553), А29 (0,042553), А33 (0,042553), А34 (0,021277) – по праймеру (AG) 9 С; G13 (0,021277), G32 (0,021277), G33 (0,021277) – по праймеру (GA) 9 C.
Фрагменты А3 при молекулярной массе 2000-1800 п.н. и А35 260-240 п.н. не выявлены.
