доля редких аллелей hµ оценивает структуру распределения частот фрагментов в популяции. Также они способны оценивать незначительные различия между популяциями по разнообразию. Наиболее это заметно при варьировании редких аллелей между популяциями.
Показатели среднего числа аллелей µ по праймерам (AG) 9 C и (GA) 9 C равны 1,622±0,051 и 1,583±0,054, соответственно, что говорит значительном разнообразии в исследуемой популяции. Так как их значение больше 1, следовательно, в популяции имеется неравномерное распределении числа аллелей.
Высокие значения hµ говорят о значительной неравномерности распределения частот фрагментов в популяции. Эти показатели соответствуют 0,923±0,017 и 0,929±0,016, поэтому можно говорить о том, что некоторые особи являются носителями значительной доли разнообразия. Таким образом, влияют на структуру популяции в целом, указывает на неравномерное распределение частот фрагментов.
Мера, или величина, информационного полиморфизма (PIC) определяется способностью маркера устанавливать полиморфизм популяции в зависимости от числа обнаруживаемых аллелей и распределения их частот (Botstein D. et all, 1980). Таким образом, PIC выявляет дискриминационную способность маркера, фактически зависит от числа устанавливаемых аллелей и распределения их частот и тем самым эквивалентна генному разнообразию. Для доминантных маркеров максимальное значение PIC составляет 0,5 (Чесноков Ю.В. и др, 2015).
Мера информационного полиморфизма (PIC) по праймерам (AG) 9 C и (GA) 9 C представлена показателями 0,233±0,004 и 0,201±0,004, соответственно. Это говорит о том, что популяция имеет умеренное генетическое разнообразие.
Таблицы 32, 33 и рисунки 13-23 характеризуют частоты встречаемости фрагментов и их распределение в разрезе линий, полученных с помощью праймера (AG) 9 С и (GA) 9 C.
В линии 8222 Rebel относительно высокая частота встречаемости по праймеру (AG) 9 С наблюдается у фрагментов А21 (0,404255) и А25 (0,425532), по праймеру (GA) 9 C – G2 (0,404255), G7 (0,489362), G23 (0,680851).
Низкие показатели частоты встречаемости представлены фрагментами А1 (0,042553), А8 (0,042553), А29 (0,042553), А33 (0,042553), А34 (0,021277) – по праймеру (AG) 9 С; G13 (0,021277), G32 (0,021277), G33 (0,021277) – по праймеру (GA) 9 C.
Фрагменты А3 при молекулярной массе 2000-1800 п.н. и А35 260-240 п.н. не выявлены.
Высокие показатели по частоте встречаемости в линия 450 имеют фрагменты А 20 (0,461538), А24 (0,461538), G23 (0,769231), G25 (0,500000).
Остальные фрагменты согласно праймерам имеют равномерное распределение. Не выявлены фрагменты: А31 (340-320 п.н.), G9 (1300-1240 п.н.), G13 (1060-1000 п.н.), G14 (1000-940 п.н.), G18 (760-720 п.н.), G 35 (260240 п.н.).
Частоты встречаемости в линии 25 по праймеру (AG)9С варьирует в пределах 0,409091-0,045455, а по праймеру (GA)9C: 0,636364-0,045455.
Фрагменты А4, А31, А35, G9, G14, G21, G32, G35, G36 не выявлены. Линия 508 по праймеру (AG)9С характеризуется равномерным распределением фрагментов (0,380952-0,047619). Относительно высокий показатель имеют фрагменты А6 с молекулярной массой 1600-1500, А13 (10601000 п.н.), А21 (640-600 п.н.), А27 (440-410 п.н.).
По праймеру (GA)9C наблюдается разбросанное соотношение частот фрагментов (0,619048-0,047619).
Не были обнаружены фрагменты: А3, А8, А19, А30, А34, А35 (праймер (AG)9С)) и G1, G9, G11, G27, G33, G36 (праймер (GA)9C)).
Частота встречаемости фрагментов по праймеру (AG)9С А21 (0,428571), А25 (0,500000), А27 (0,428571) в линии 34 представлена наиболее высокими показателями. Распределение частот по праймеру (GA)9C происходит та ким образом, что фрагменты G2, G24 имеют сравнительно высокий показатель внутри линии (0,500000).
По обоим праймерам не выявлено более17 фрагментов.
В линии 8227 RAMON превалирующие показатели имеют фрагменты: А20 (680-640 п.н.) – 0,583333; А24 (530-500 п.н.) и А27 (440-410 п.н.) – 0,500000; G23 (560-530 п.н.), G24 (530-500 п.н.), G25 (400-470 п.н.) – 0,500000. Остальные выявленные фрагменты по праймерам (AG)9С и (GA)9C варьируют в пределах 0,416667-0,083333.
29 линия по частоте встречаемости (праймер (AG)9С)) характеризуется тем, что значительная часть фрагментов имеют значения выше среднего показателя по стаду (0,363636-0,545455).
Наблюдается значительное варьирование показателей среди фрагментов, полученных с помощью праймера (GA) 9 C (0,636364-0,090909).
Неравномерное распределение частот фрагментов внутри линии 20 по праймерам (AG)9С и GA)9C представлено значениями 0,571429-0,142857.
Во всех линиях по обоим праймерам не выявлены фрагменты: A36(240220 п.н.), A37 (220-200 п.н.), A38 (200-160 п.н.), G37 (220-200 п.н.), G38 (200160 п.н.).
Таблица - 32 Частоты встречаемости фрагментов в разрезе линий, полученных с помощью праймера (AG) 9 С
| Фра гме нты | ИРФ, п.н. | Линии | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| гме | ИРФ, п.н. | 8222 | 8227 | 8217 | ||||||||
| нты | Rebel | 450 | 25 | 508 | 34 | Ramon | Rekrut | 29 | 20 | 115 | 18 | |
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 |
| A1 | 2500-2300 | 0,042553 | 0,038462 | 0,136364 | 0,142857 | - | - | 0,100000 | 0,090909 | - | - | - |
| A2 | 2300-2000 | 0,063830 | 0,076923 | 0,090909 | 0,047619 | 0,071429 | - | - | 0,090909 | 0,142857 | - | - |
| A3 | 2000-1800 | - | 0,038462 | 0,045455 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| A4 | 1800-1700 | 0,063830 | 0,153846 | - | 0,047619 | 0,071429 | - | 0,200000 | - | 0,142857 | - | - |
| A5 | 1700-1600 | 0,063830 | 0,153846 | 0,136364 | 0,095238 | 0,214286 | 0,166667 | 0,100000 | 0,181818 | 0,142857 | - | - |
| A6 | 1600-1500 | 0,297872 | 0,115385 | 0,181818 | 0,380952 | 0,285714 | 0,416667 | 0,200000 | 0,454545 | - | 0,200000 | 0,250000 |
| A7 | 1500-1400 | 0,255319 | 0,230769 | 0,272727 | 0,238095 | 0,071429 | 0,083333 | 0,100000 | 0,272727 | 0,142857 | - | 0,500000 |
| A8 | 1400-1300 | 0,042553 | 0,038462 | 0,090909 | - | 0,071429 | - | 0,100000 | - | - | 0,200000 | 0,250000 |
| A9 | 1300-1240 | 0,127660 | 0,192308 | 0,090909 | 0,095238 | - | 0,333333 | 0,200000 | 0,363636 | 0,142857 | 0,200000 | 0,250000 |
| A10 | 1240-1180 | 0,191489 | 0,115385 | 0,181818 | 0,285714 | 0,285714 | 0,083333 | 0,300000 | 0,363636 | - | - | 0,250000 |
| A11 | 1180-1120 | 0,106383 | 0,076923 | 0,136364 | 0,095238 | - | 0,166667 | 0,300000 | - | - | - | 0,500000 |
| A12 | 1120-1060 | 0,085106 | 0,192308 | 0,227273 | 0,047619 | 0,214286 | 0,166667 | 0,200000 | 0,090909 | 0,142857 | 0,200000 | - |
| A13 | 1060-1000 | 0,319149 | 0,230769 | 0,181818 | 0,428571 | 0,357143 | 0,416667 | 0,500000 | 0,545455 | 0,285714 | 0,200000 | 0,500000 |
| A14 | 1000-940 | 0,212766 | 0,269231 | 0,363636 | 0,190476 | 0,071429 | 0,083333 | - | 0,090909 | 0,142857 | - | - |
| A15 | 940-880 | 0,191489 | 0,153846 | 0,181818 | 0,047619 | 0,142857 | 0,166667 | 0,200000 | 0,181818 | - | 0,200000 | 0,750000 |
| A16 | 880-820 | 0,148936 | 0,230769 | 0,136364 | 0,333333 | 0,285714 | 0,250000 | 0,400000 | 0,363636 | 0,142857 | 0,200000 | 0,250000 |
| A17 | 820-760 | 0,276596 | 0,307692 | 0,318182 | 0,285714 | 0,071429 | 0,333333 | 0,300000 | 0,545455 | 0,142857 | 0,400000 | 0,250000 |
| A18 | 760-720 | 0,148936 | 0,076923 | 0,045455 | 0,238095 | 0,214286 | 0,166667 | 0,100000 | 0,272727 | - | - | 0,250000 |
| A19 | 720-680 | 0,063830 | 0,076923 | 0,136364 | - | - | - | 0,100000 | - | - | 0,200000 | 0,250000 |
| A20 | 680-640 | 0,255319 | 0,461538 | 0,227273 | 0,333333 | 0,214286 | 0,583333 | 0,500000 | 0,272727 | 0,142857 | 0,200000 | - |
| A21 | 640-600 | 0,404255 | 0,192308 | 0,409091 | 0,380952 | 0,428571 | 0,416667 | 0,400000 | 0,545455 | - | 0,200000 | 0,750000 |
| A22 | 600-560 | 0,255319 | 0,230769 | 0,227273 | 0,285714 | 0,214286 | - | 0,100000 | 0,181818 | 0,428571 | 0,400000 | 0,250000 |
| A23 | 560-530 | 0,191489 | 0,153846 | 0,090909 | 0,142857 | 0,214286 | 0,083333 | 0,100000 | - | - | 0,200000 | - |
