Таблица 29- Частоты встречаемости фрагментов, полученных с помощью праймеров (AG)9С и (GA)9C
| Фрагменты | ИРФ | Частота встречаемости | Фрагменты | ИРФ | Частота встречаемости |
|---|---|---|---|---|---|
| A1 | 2500-2300 | 0,059459 | G1 | 2500-2300 | - |
| A2 | 2300-2000 | 0,059459 | G2 | 2300-2000 | 0,054054 |
| A3 | 2000-1800 | 0,010811 | G3 | 2000-1800 | 0,400000 |
| A4 | 1800-1700 | 0,064865 | G4 | 1800-1700 | 0,210811 |
| A5 | 1700-1600 | 0,124324 | G5 | 1700-1600 | 0,172973 |
| A6 | 1600-1500 | 0,259459 | G6 | 1600-1500 | 0,189189 |
| A7 | 1500-1400 | 0,210811 | G7 | 1500-1400 | 0,091892 |
| A8 | 1400-1300 | 0,048649 | G8 | 1400-1300 | 0,475676 |
| A9 | 1300-1240 | 0,162162 | G9 | 1300-1240 | 0,124324 |
| A10 | 1240-1180 | 0,194595 | G10 | 1240-1180 | 0,016216 |
| A11 | 1180-1120 | 0,108108 | G11 | 1180-1120 | 0,081081 |
| A12 | 1120-1060 | 0,151351 | G12 | 1120-1060 | 0,064865 |
| A13 | 1060-1000 | 0,335135 | G13 | 1060-1000 | 0,124324 |
| A14 | 1000-940 | 0,183784 | G14 | 1000-940 | 0,032432 |
| A15 | 940-880 | 0,172973 | G15 | 940-880 | 0,059459 |
| A16 | 880-820 | 0,237838 | G16 | 880-820 | 0,102703 |
| A17 | 820-760 | 0,297297 | G17 | 820-760 | 0,081081 |
| A18 | 760-720 | 0,140541 | G18 | 760-720 | 0,124324 |
| A19 | 720-680 | 0,059459 | G19 | 720-680 | 0,059459 |
| A20 | 680-640 | 0,324324 | G20 | 680-640 | 0,054054 |
| A21 | 640-600 | 0,362162 | G21 | 640-600 | 0,048649 |
| A22 | 600-560 | 0,227027 | G22 | 600-560 | 0,043243 |
| A23 | 560-530 | 0,129730 | G23 | 560-530 | 0,243243 |
| A24 | 530-500 | 0,351351 | G24 | 530-500 | 0,632432 |
| A25 | 400-470 | 0,345946 | G25 | 400-470 | 0,405405 |
| A26 | 470-440 | 0,243243 | G26 | 470-440 | 0,383784 |
| A27 | 440-410 | 0,340541 | G27 | 440-410 | 0,059459 |
| A28 | 410-380 | 0,237838 | G28 | 410-380 | 0,027027 |
| A29 | 380-360 | 0,070270 | G29 | 380-360 | 0,216216 |
| A30 | 360-340 | 0,070270 | G30 | 360-340 | 0,054054 |
| A31 | 340-320 | 0,081081 | G31 | 340-320 | 0,113514 |
| A32 | 320-300 | 0,091892 | G32 | 320-300 | 0,167568 |
| A33 | 300-280 | 0,048649 | G33 | 300-280 | 0,037838 |
| A34 | 280-260 | 0,016216 | G34 | 280-260 | 0,043243 |
| A35 | 260-240 | 0,005405 | G35 | 260-240 | 0,227027 |
| A36 | 240-220 | - | G36 | 240-220 | 0,010811 |
| A37 | 220-200 | - | G37 | 220-200 | 0,005405 |
| A38 | 200-160 | 0,059459 | G38 | 200-160 | - |
На рисунках 11 и 12 приведены гистограммы распределения частот фрагментов по маркерам (AG)9С-PCR и (GA)9С-PCR соответственно.
0,4
0,35
0,3
0,25
0,2
0,15
0,1
0,05
0
A1 A3 A5 A7 A9 A11 A13 A15 A17 A19 A21 A23 A25 A27 A29 A31 A33 A35 A37
Фрагменты
Рисунок 11 - Частоты встречаемости фрагментов, полученных
с помощью олигонуклеотида (AG)9С
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
G1 G3 G5 G7 G9 G11 G13 G15 G17 G19 G21 G23 G25 G27 G29 G31 G33 G35 G37
Фрагменты
Частота встречаемости
Частота встречаемости
Рисунок 12 - Частоты встречаемости фрагментов, полученных с помощью олигонуклеотида (GA)9C
В таблицах 30 и 31 представлены оценки генетического разнообразия у исследованных популяций романовской породы овец. Показатели индекса Шеннона показывают генетическое разнообразие и могут свидетельствовать об отсутствии инбредной депрессии в популяции или ее жёсткой изоляции (Столповский Ю.А. и др., 2010). Анализируя полученные данные видно, что генетическое разнообразие, выявленное по индексу Шеннона с использованием олигонуклеотидов (AG) 9 C и (GA) 9 C составляет 0,239±0,003 и 0,214±0,003, соответственно. На основании полученных результатов можно сделать вывод о том, что данная микропопуляция относительно благополучна по выявленному внутрипопуляционному генетическому разнообразию.
Таблица 30- Параметры генетического разнообразия популяций романовской породы овец с использованием AG-ISSR-PCR маркеров
| Выборка | Средний на локус | Мера | Среднее число | Доля редких |
|---|---|---|---|---|
| индекс информации Шеннона, I (Lewontin, 1972) (±se) | информационного полиморфизма (PIC) | аллелей µ (Животовский, 1991) (±sµ) | аллелей hµ (Животовский, 1991) (±sh) | |
| 185 | 0,239±0,003 | 0,233±0,004 | 1,622±0,051 | 0,923±0,017 |
Обозначения: se – стандартная ошибка; sµ – ошибка среднего числа аллелей; sh – ошибка доли редких аллелей.
Таблица 31 - Параметры генетического разнообразия популяций романовской породы овец с использованием GA-ISSR-PCR маркеров
| Выборка | Средний на | Мера | Среднее число | Доля редких |
|---|---|---|---|---|
| локус индекс | информационног | аллелей µ | аллелей hµ | |
| информации | о полиморфизма | (Животовский, | (Животовский, | |
| Шеннона, I (Lewontin, 1972) (±se) | (PIC) | 1991) (±sµ) | 1991) (±sh) | |
| 185 | 0,214±0,003 | 0,201±0,004 | 1,583±0,054 | 0,929±0,016 |
Обозначения: se – стандартная ошибка; sµ – ошибка среднего числа аллелей; sh – ошибка доли редких аллелей.
Внутрипопуляционное разнообразие проанализировано также с помощью параметров среднего числа аллелей µ и доли редких аллелей hµ (Животовский Л.А., 1980; 1991). Среднее число аллелей µ оценивает степень разнообразия,
