Дендрограммы филогенетического сходства на основании генетического расстояния, рассчитанного по данным AG и GA-ISSR анализа, построенные на языке программирования Python, позволяют увидеть другую картину. На дендрограмме по маркеру (AG)9С-PCR популяция делится на 2 схожих кластера. Первый кластер образуют линии 8217 Rekrut, 8227 Ramon и линия 29. Второй кластер, в свою очередь, подразделяется на две родственные группы, включающие в себя линии 450 и 20, для первой группы, и линии 25, 508, 8222 Rebel и 34, для второй. Линии 115 и 18 не были включены ни в один из кластеров, описывающих структуру филогенетического сходства, так как они имеют максимальное генетическое расстояние, а, следовательно, незначительно отличаются по частотам аллелей в локусах данного маркера (рис. 26)
Для маркера (GA)9С-PCR наблюдается схожая картина. Выделяются два кластера, причём распределение линий, совпадают c таковым по маркеру (AG)9С-PCR. Линии 115 и 18 формируют отдельный кластер. Остальные линии объединяются в один большой кластер, но распределение внутри кластера относительно (AG)9С-PCR-маркера претерпевает изменение (рис 27).
Внутренняя структура большего кластера имеет следующую схему. Линии 8222 Rebel, 25, 8227 Ramon, 508 и 8217 Rekrut образуют отдельный кластер, к которому присоединяются два подкластера образованные линиями 450, 29 и 20, 34.
