Такая разница в распределении кластеров (AG)9С-PCR и (GA)9С-PCR маркеров определяется в зависимости от различных значений генетического расстояния между разными линиями и характеризует внутрипородную, в случае AG-ISSR анализа, и внутривидовую, в случае GA-ISSR анализа, дифференциацию внутри популяции.
Несмотря на различия в значениях генетического расстояния исследованных линий, в популяции овец романовской породы можно сказать, что эти показатели малы и, следовательно, популяция является однородной. Например, в работе Феофилова А.В. проведена оценка генофонда и рассчитаны генетические расстояния между овцами калмыцкой и эдильбаевской породы. Полученные значения довольно велики и составляют от 0,1664 до 0,2813 (Феофилов А.В. и др., 2013).
Линии 115 и 18 занимают обособленное положение по показателям (AG)9С-PCR и (GA)9С-PCR маркеров. Данные линии могут использоваться как генетический потенциал для поддержания внутрипородного разнообразия, а также для уменьшения негативного влияния инбридинга.
Метод главных компонент позволяет провести анализ полученных данных по ISSR и выбрать наиболее хорошо описывающие распределение параметры выборки или рассчитать такой показатель. На его основе происходит снижение размерности данных, что значительно упрощает их анализ и позволяет провести визуализацию полученных данных.
На рисунке 28 изображено распределение особей на основе двух рассчитанных компонент по результатам анализа по AG-ISSR-PCR маркерам.
Распределения особи разных линий равномерно распределены по плоскости и не обнаруживается каких-либо кластеров положения. Из чего можно сделать предположение, что данные линии очень близки по изучаемому показателю, а показатели породной принадлежности слабо флуктуируют в этой популяции, что подтверждается их отношением к одному хозяйству.
Сходная картина наблюдается и по GA-ISSR-PCR маркерам рисунок 29 Распределение особей по этому маркеру также показало равномерное распределение по плоскости, образованной рассчитанными показателями главных компонент, что может указывать на слабую флуктуацию параметров, определяющих видовую принадлежность.
В таблицах 34 и 35 представлены оценки генетического разнообразия у исследованной популяций романовской породы овец в разрезе линий. Рассматривая полученные данные видно, что наибольшее генетическое разнообразие по Шеннону и Нею (праймер (AG) 9 C) выявлено в линии 8222 Rebel (0,230±0,003 и 0,225±0,025, соответственно). По праймеру (GA) 9 C этот показатель превалирует в линии 508 (0,212±0,003 и 0,211±0,026, соответственно).
Наименьшие значения этих индексов генного разнообразия по обоим праймерам зафиксировано в линиях: 20 (0,136±0,004 и 0,142±0,028, соответственно – праймер (AG) 9 C) и 115 (0,121±0,004 и 0,126±0,027, соответственно – праймер (GA) 9 C).
