Для маркера (GA)9С-PCR наблюдается схожая картина. Выделяются два кластера, причём распределение линий, совпадают c таковым по маркеру (AG)9С-PCR. Линии 115 и 18 формируют отдельный кластер. Остальные линии объединяются в один большой кластер, но распределение внутри кластера относительно (AG)9С-PCR-маркера претерпевает изменение (рис 27).
Внутренняя структура большего кластера имеет следующую схему. Линии 8222 Rebel, 25, 8227 Ramon, 508 и 8217 Rekrut образуют отдельный кластер, к которому присоединяются два подкластера образованные линиями 450, 29 и 20, 34.
Такая разница в распределении кластеров (AG)9С-PCR и (GA)9С-PCR маркеров определяется в зависимости от различных значений генетического расстояния между разными линиями и характеризует внутрипородную, в случае AG-ISSR анализа, и внутривидовую, в случае GA-ISSR анализа, дифференциацию внутри популяции.
Несмотря на различия в значениях генетического расстояния исследованных линий, в популяции овец романовской породы можно сказать, что эти показатели малы и, следовательно, популяция является однородной. Например, в работе Феофилова А.В. проведена оценка генофонда и рассчитаны генетические расстояния между овцами калмыцкой и эдильбаевской породы. Полученные значения довольно велики и составляют от 0,1664 до 0,2813 (Феофилов А.В. и др., 2013).
Линии 115 и 18 занимают обособленное положение по показателям (AG)9С-PCR и (GA)9С-PCR маркеров. Данные линии могут использоваться как генетический потенциал для поддержания внутрипородного разнообразия, а также для уменьшения негативного влияния инбридинга.
Метод главных компонент позволяет провести анализ полученных данных по ISSR и выбрать наиболее хорошо описывающие распределение параметры выборки или рассчитать такой показатель. На его основе происходит снижение размерности данных, что значительно упрощает их анализ и позволяет провести визуализацию полученных данных.
На рисунке 28 изображено распределение особей на основе двух рассчитанных компонент по результатам анализа по AG-ISSR-PCR маркерам.
Распределения особи разных линий равномерно распределены по плоскости и не обнаруживается каких-либо кластеров положения. Из чего можно сделать предположение, что данные линии очень близки по изучаемому показателю, а показатели породной принадлежности слабо флуктуируют в этой популяции, что подтверждается их отношением к одному хозяйству.
Сходная картина наблюдается и по GA-ISSR-PCR маркерам рисунок 29 Распределение особей по этому маркеру также показало равномерное распределение по плоскости, образованной рассчитанными показателями главных компонент, что может указывать на слабую флуктуацию параметров, определяющих видовую принадлежность.
