В таблицах 34 и 35 представлены оценки генетического разнообразия у исследованной популяций романовской породы овец в разрезе линий. Рассматривая полученные данные видно, что наибольшее генетическое разнообразие по Шеннону и Нею (праймер (AG) 9 C) выявлено в линии 8222 Rebel (0,230±0,003 и 0,225±0,025, соответственно). По праймеру (GA) 9 C этот показатель превалирует в линии 508 (0,212±0,003 и 0,211±0,026, соответственно).
Наименьшие значения этих индексов генного разнообразия по обоим праймерам зафиксировано в линиях: 20 (0,136±0,004 и 0,142±0,028, соответственно – праймер (AG) 9 C) и 115 (0,121±0,004 и 0,126±0,027, соответственно – праймер (GA) 9 C).
Таблица 34 -Параметры генетического разнообразия популяций романовской породы овец с использованием AG-ISSR-PCR маркеров в разрезе линий
| Выборка | Полимо рфных локусов, % | Средний на локус индекс информации Шеннона, I (Lewontin, 1972) (±se) | Среднее на локус генное разнообразие, HT (Nei, 1987) (±se) | Мера информацион ного полиморфизм а (PIC) | Среднее число аллелей µ (Животовск ий, 1991) (±sµ) | Доля редких аллелей hµ (Животовски й, 1991) (±sh) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 8222 Rebel | 86,842 | 0,230±0,003 | 0,225±0,025 | 0,225±0,004 | 1,600±0,114 | 0,926±0,037 |
| 450 | 86,842 | 0,230±0,003 | 0,221±0,024 | 0,221±0,004 | 1,598±0,115 | 0,927±0,037 |
| 25 | 84,211 | 0,232±0,003 | 0,228±0,025 | 0,228±0,004 | 1,600±0,113 | 0,925±0,037 |
| 508 | 76,316 | 0,221±0,004 | 0,230±0,028 | 0,230±0,005 | 1,574±0,111 | 0,920±0,036 |
| 34 | 73,684 | 0,208±0,004 | 0,212±0,028 | 0,212±0,005 | 1,541±0,118 | 0,927±0,034 |
| 8227 Ramon | 68,421 | 0,203±0,004 | 0,220±0,030 | 0,220±0,005 | 1,536±0,116 | 0,917±0,034 |
| 29 | 65,789 | 0,209±0,004 | 0,240±0,032 | 0,240±0,005 | 1,553±0,103 | 0,906±0,036 |
| 8217 Rekrut | 76,316 | 0,227±0,004 | 0,237±0,028 | 0,237±0,005 | 1,589±0,114 | 0,916±0,037 |
| 20 | 44,737 | 0,136±0,004 | 0,142±0,028 | 0,142±0,005 | 1,352±0,131 | 0,949±0,022 |
| 115 | 44,737 | 0,146±0,004 | 0,160±0,030 | 0,160±0,005 | 1,377±0,126 | 0,939±0,024 |
| 18 | 52,632 | 0,176±0,005 | 0,217±0,034 | 0,217±0,006 | 1,477±0,127 | 0,901±0,032 |
Расчет индекса PIC (polymorphic information contents) в разрезе линий для диаллельных локусов, для которых PIC = = 2f(1 - f), где f — частота одного из двух аллелей, индекс PIC характеризует уровень ожидаемой гетерозиготное™ локусов - продуктов амплификации, исходя из представлений о том, что по каждому локусу исследованная группа животных находится в равновесном состоянии, соответствующему закону Харди-Вайнберга.
Уровень ожидаемой гетерозиготности по выявленным ампликонам, фланкированным инвертированным повтором последовательности (TC) AG, среди исследованной романовской породы овец показал, что по этому параметру линии 29 (0,240±0,005), 8217 Rekrut (0,237±0,005), 508 (0,230±0,005) превосходят все остальные, а показатель PIC не зависит от количества (полиили мономорфных) локусов.
Для (GA) 9 C праймера показатели PIC находились приблизительно на одинаковом уровне. Наиболее высокий показатель ожидаемой гетерозиготности наблюдался в линии 508 (0,211±0,004), 18 (0,191±0,005), 8222 Rebel (0,190±0,004), 25 (0,190±0,004), а в линии 115 - всего 0,126±0,005.
Таблица 35- Параметры генетического разнообразия популяций романовской породы овец с использованием GA-ISSR-PCR маркеров в разрезе линий
| Выборка | Полимо рфных локусов, % | Средний на локус индекс информации Шеннона, I (Lewontin, 1972) (±se) | Среднее на локус генное разнообрази е, HT (Nei, 1987) (±se) | Мера информационн ого полиморфизма (PIC) | Среднее число аллелей µ (Животовски й, 1991) (±sµ) | Доля редких аллелей hµ (Животовски й, 1991) (±sh) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 8222 Rebel | 89,474 | 0,203±0,003 | 0,190±0,024 | 0,190±0,004 | 1,551±0,122 | 0,933±0,034 |
| 450 | 81,579 | 0,195±0,003 | 0,189±0,026 | 0,189±0,004 | 1,527±0,124 | 0,930±0,033 |
| 25 | 78,947 | 0,194±0,003 | 0,190±0,026 | 0,190±0,004 | 1,521±0,121 | 0,931±0,032 |
| 508 | 78,947 | 0,212±0,003 | 0,211±0,026 | 0,211±0,004 | 1,560±0,115 | 0,923±0,035 |
| 34 | 65,789 | 0,176±0,004 | 0,173±0,027 | 0,173±0,004 | 1,463±0,130 | 0,940±0,029 |
| 8227 Ramon | 63,158 | 0,172±0,004 | 0,182±0,030 | 0,182±0,005 | 1,462±0,127 | 0,931±0,029 |
| 29 | 52,632 | 0,162±0,004 | 0,185±0,032 | 0,185±0,005 | 1,433±0,117 | 0,926±0,028 |
| 8217 | 60,526 | 0,176±0,027 | ||||
| Rekrut | 0,170±0,004 | 0,176±0,004 | 1,453±0,130 | 0,929±0,029 | ||
| 20 | 44,737 | 0,144±0,004 | 0,165±0,032 | 0,165±0,005 | 1,380±0,122 | 0,934±0,025 |
| 115 | 36,842 | 0,121±0,004 | 0,126±0,027 | 0,126±0,005 | 1,304±0,135 | 0,945±0,021 |
| 18 | 47,368 | 0,157±0,004 | 0,191±0,033 | 0,191±0,005 | 1,424±0,129 | 0,914±0,028 |
Согласно показателям полиморфных локусов, средний на локус индекс информации Шеннона, среднее на локус генное разнообразие по Nei можно утверждать, что во всех линиях не отмечается инбредная депрессия.
Среди исследованных линий популяции романовской породы неравномерное распределение частот аллелей наблюдается у овец линии 20, так как отмечается минимальное значение среднего числа аллелей µ по AG-ISSRPCR (µ=1,352±0,131). Это подтверждается также и высокими значениями показателя hµ (0,949±0,022) в данной популяции.
В наибольшей степени равномерное распределение частот аллелей AGISSR-фрагментов отмечено в линиях 8222 Rebel и 25, так как они имеют самые высокие значения среднего числа аллелей µ=1,600±0,114 и 1,600±0,113, соответственно при средних долях редких аллелей hµ=0,926±0,037 и 0,925±0,037, соответственно.
Среди изученных популяций по GA-ISSR-PCR маркеру равномерное распределение частот аллелей свойственно выборке линии 508 (µ=1,560±0,115;
