Несмотря на различия в значениях генетического расстояния исследованных линий, в популяции овец романовской породы можно сказать, что эти показатели малы и, следовательно, популяция является однородной. Например, в работе Феофилова А.В. проведена оценка генофонда и рассчитаны генетические расстояния между овцами калмыцкой и эдильбаевской породы. Полученные значения довольно велики и составляют от 0,1664 до 0,2813 (Феофилов А.В. и др., 2013).
Линии 115 и 18 занимают обособленное положение по показателям (AG)9С-PCR и (GA)9С-PCR маркеров. Данные линии могут использоваться как генетический потенциал для поддержания внутрипородного разнообразия, а также для уменьшения негативного влияния инбридинга.
Метод главных компонент позволяет провести анализ полученных данных по ISSR и выбрать наиболее хорошо описывающие распределение параметры выборки или рассчитать такой показатель. На его основе происходит снижение размерности данных, что значительно упрощает их анализ и позволяет провести визуализацию полученных данных.
На рисунке 28 изображено распределение особей на основе двух рассчитанных компонент по результатам анализа по AG-ISSR-PCR маркерам.
Распределения особи разных линий равномерно распределены по плоскости и не обнаруживается каких-либо кластеров положения. Из чего можно сделать предположение, что данные линии очень близки по изучаемому показателю, а показатели породной принадлежности слабо флуктуируют в этой популяции, что подтверждается их отношением к одному хозяйству.
Сходная картина наблюдается и по GA-ISSR-PCR маркерам рисунок 29 Распределение особей по этому маркеру также показало равномерное распределение по плоскости, образованной рассчитанными показателями главных компонент, что может указывать на слабую флуктуацию параметров, определяющих видовую принадлежность.
В таблицах 34 и 35 представлены оценки генетического разнообразия у исследованной популяций романовской породы овец в разрезе линий. Рассматривая полученные данные видно, что наибольшее генетическое разнообразие по Шеннону и Нею (праймер (AG) 9 C) выявлено в линии 8222 Rebel (0,230±0,003 и 0,225±0,025, соответственно). По праймеру (GA) 9 C этот показатель превалирует в линии 508 (0,212±0,003 и 0,211±0,026, соответственно).
Наименьшие значения этих индексов генного разнообразия по обоим праймерам зафиксировано в линиях: 20 (0,136±0,004 и 0,142±0,028, соответственно – праймер (AG) 9 C) и 115 (0,121±0,004 и 0,126±0,027, соответственно – праймер (GA) 9 C).
Таблица 34 -Параметры генетического разнообразия популяций романовской породы овец с использованием AG-ISSR-PCR маркеров в разрезе линий
| Выборка | Полимо рфных локусов, % | Средний на локус индекс информации Шеннона, I (Lewontin, 1972) (±se) | Среднее на локус генное разнообразие, HT (Nei, 1987) (±se) | Мера информацион ного полиморфизм а (PIC) | Среднее число аллелей µ (Животовск ий, 1991) (±sµ) | Доля редких аллелей hµ (Животовски й, 1991) (±sh) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 8222 Rebel | 86,842 | 0,230±0,003 | 0,225±0,025 | 0,225±0,004 | 1,600±0,114 | 0,926±0,037 |
| 450 | 86,842 | 0,230±0,003 | 0,221±0,024 | 0,221±0,004 | 1,598±0,115 | 0,927±0,037 |
| 25 | 84,211 | 0,232±0,003 | 0,228±0,025 | 0,228±0,004 | 1,600±0,113 | 0,925±0,037 |
| 508 | 76,316 | 0,221±0,004 | 0,230±0,028 | 0,230±0,005 | 1,574±0,111 | 0,920±0,036 |
| 34 | 73,684 | 0,208±0,004 | 0,212±0,028 | 0,212±0,005 | 1,541±0,118 | 0,927±0,034 |
| 8227 Ramon | 68,421 | 0,203±0,004 | 0,220±0,030 | 0,220±0,005 | 1,536±0,116 | 0,917±0,034 |
| 29 | 65,789 | 0,209±0,004 | 0,240±0,032 | 0,240±0,005 | 1,553±0,103 | 0,906±0,036 |
| 8217 Rekrut | 76,316 | 0,227±0,004 | 0,237±0,028 | 0,237±0,005 | 1,589±0,114 | 0,916±0,037 |
| 20 | 44,737 | 0,136±0,004 | 0,142±0,028 | 0,142±0,005 | 1,352±0,131 | 0,949±0,022 |
| 115 | 44,737 | 0,146±0,004 | 0,160±0,030 | 0,160±0,005 | 1,377±0,126 | 0,939±0,024 |
| 18 | 52,632 | 0,176±0,005 | 0,217±0,034 | 0,217±0,006 | 1,477±0,127 | 0,901±0,032 |
Расчет индекса PIC (polymorphic information contents) в разрезе линий для диаллельных локусов, для которых PIC = = 2f(1 - f), где f — частота одного из двух аллелей, индекс PIC характеризует уровень ожидаемой гетерозиготное™ локусов - продуктов амплификации, исходя из представлений о том, что по каждому локусу исследованная группа животных находится в равновесном состоянии, соответствующему закону Харди-Вайнберга.
Уровень ожидаемой гетерозиготности по выявленным ампликонам, фланкированным инвертированным повтором последовательности (TC) AG, среди исследованной романовской породы овец показал, что по этому параметру линии 29 (0,240±0,005), 8217 Rekrut (0,237±0,005), 508 (0,230±0,005) превосходят все остальные, а показатель PIC не зависит от количества (полиили мономорфных) локусов.
Для (GA) 9 C праймера показатели PIC находились приблизительно на одинаковом уровне. Наиболее высокий показатель ожидаемой гетерозиготности наблюдался в линии 508 (0,211±0,004), 18 (0,191±0,005), 8222 Rebel (0,190±0,004), 25 (0,190±0,004), а в линии 115 - всего 0,126±0,005.
