Наиболее информативным, на наш взгляд, является индекс генетической устойчивости (И), который показывает насколько использование данного быка повышает или понижает заболеваемость (данной болезнью) в группе дочерей, относительно заболеваемости в стаде в целом. Этот индекс можно рассчитывать и с учетом заболеваемости матерей, что позволит несколько повысить достоверность оценки производителя.
Оценка маркируюшего эффекта аллелей и антигенгов по устойчивости к болезням.
Настоящий раздел будет описан по А.А.Певницкому для антигенов НГА. Мы также будем, в качестве примера использовать данные по антигенам BoLA, но имеется в виду, что эта методика приемлема для оценки отдельных аллелей групп крови и полиморфных белков, а также эритроцитарных антигенов.
Для определения значимости различия частот BoLA- антигенов в сравниваемых группах обычно используют критерий 7х7. Первичный материал по распределению ВоГ.А-антигенов у обследованных больных и здоровых животных представляется в виде четырехпольной таблицы:
Таблица 72 РАспределение антигенов у обследованных животных
| + | |
|---|---|
| Здоровые | с |
где: а — число больных с наличием данного антигена;
Ь — число больных у которых антиген отсутствует;
с — число здоровых с наличием антигена;
4 — число здоровых с отсутствием антигена.
Такие таблицы составляются для всех определяемых ВоГ.Аспицифичностей.
Величину x? вычисляется по формуле:
= (с x d)-(b x c)-(0,5x пр (a+b) х(с +d) х(а + с) x(b +d)
(25)
где: 0,5 X п — поправка Ha непрерывность для малой выборки. Эту поправку всегда целесообразно использовать, поскольку число больных животных, в ряде исследований, не достигает больших величин (особенно при мало распространенных заболеваниях). При достаточно крупных выборках поправка существенно не изменяет значения 7х2. Величину Р (достоверность разницы), соответствующую найденному 72, находят из таблицы x” при одной степени свободы df=1.
Тест y? применяется в тех случаях, когда п меньше 20 и все ожидаемые значения наблюдаемых частот а, b, с, 4 больше 5. Ожидаемые частоты (Е) расчитывают по формуле:
Е = (а+Б)х(а=с)
а on
Е, оп(a+b) 4(b +d) итд (26)
При невыполнении указанных условий необходимо применять точный метод Фишера, используя либо разработанные таблицы, либо вычисляя значение Р по соответствующей формуле. Точный метод Фишера применяют и при больших выборках, хотя эти вычисления довольно громоздки. Однако, в таких случаях использование критерия 7? дает достаточно надежные результаты. В биологической статистике значение y? , превышающее 3,841 (что соответствует P>0,5 ), обычно рассматривается как показатель достоверной разницы между частотами в сравниваемых группах. Однако для новых, т.е. впервые обнаруженных ассоциаций ВоГ.А-антигенов с заболеваниями статистика включает еще один обязательный, но часто не учитываемый элемент, который и определяет оценку достоверности найденных ассоциаций. Речь идет о том, что при изучении частот ВоГ.А-антигенов в двух BbI-
борках (больные- здоровые) обычно проводят порядка 20 и более сравнений соответственно числу исследуемых антигенов. В этом случае можно ожидать, что даже при отсутствии действительно существующих различий между частотами сравниваемых антигенов одно сравнение из 20 (т.е. с вероятностью 0,5) случайно даст величину характеризующуюся, как достоверную. Чтобы избежать ошибочного заключения о наличии ассоцияции, необходимо корректировать, найденное при помощи метода д? (или точным методом Фишера) значение Р соответственно числу определяемых антигенов, т.е. числу сравнений. Коррекцию можно проводить по формуле:
P,_ =1-(1-P)” (27)
где: P,— скорректированное значение Р;
Р — найденное ранее значение;
п — число антигенов.
Применение формулы (27) предполагает вычисление точного значения P . Такую возможность дает метод Фишера, однако при использовании критерия x? для этого, как правило приходится прибегать к логарифмической интерполяции.
Чтобы избежать дополнительных вычислений, большинство исследователей используют другой способ определения Р.. Практически то же значение Р. ‚ как и вычисленное по формуле (27) дает величина P , умноженная на число антигенов (так называемый способ Банферони). Например, если Р=0,01 и BoLA тестирование проведено по 20 антигенам, To P=0,1 x 20=0,2 (различие не достоверно), при Р=0,001, Р. = 0,001 x 20=0,02 (различие достоверно) и т.д. Соответственно величина P, вычисленная по формуле (27) составляет 0,18 ц,0,02. Исходя из этого, при планировании работы исследователь сразу имеет возможность определить величину Р при которой различия в частоте ВоГА-антигенов можно будет считать достоверными. Существуют и таблицы значений х2 для разных уровней значимостиР и числа антигенов п.
Помимо статистической достоверности, существует понятие силы ассоциации. Ее показателем является величина, так называемого, относитерьного риска — ВВ (relafive rick) . которую
