ченных результатов сделан вывод, что самый высокий полиморфизм гена ОВВ имеет место у холмогорской породы.
Вариант А (генотип), имеющий только фрагмент в 141 п.н., был подвергнут рестриктному анализу рестриктазами М5р! и Hinfl. Анализ показал наличие полиморфизма, позволившего выделить 6 подвариантов этого варианта (табл. 9).
Полиморфизм гена BoLA-DQB исследованы по 5*нетранслируемой области гена. Изучение полиморфизма регуляторной области гена представляет особый интерес, т.к. в этом случае можно ожидать, что варианты полиморфизма чаще будут значимыми, т.е. разные аллельные варианты могут различаться по уровню активности или специфичности. Определенный интерес представляет также оценка уровня вариабильности этой области гена у разных пород и групп животных.
При амплификации указанного участка гена у черно-пестрой и герефордской пород, а также у зубров был обнаружен фрагмент, размер которого составлял 149 п.н. и частота 1.0, т.е. все исследованные животные данных групп имели один аллельный вариант. Этот вариант обозначен, как L. У холмогорской породы этот вариант имел частоту 0,533, т.е. почти в 2 раза ниже, чем в других группах. (табл. 10). М-вариант имеет размер 156 п.н. и частота его у холмогорских животных довольно высокая (0,266). У отдельных животных обнаружены оба варианта, а их генотип был обозначен, как ГМ. Кроме этого у животных холмогорской породы имели место случаи отсутствия амплификации, обозначенные как 0-вариант. Авторы объясняют отсутствие амплификации или заменами в районе 3'-концевых нуклеотидов, что препятствует амплификации или иными более сложными изменениями нуклеотидной последовательности исследуемого участка. Однако, это не является артефактом, поскольку те же образцы с другими парами праймеров давали эффективную амплификацию. Таким образом, 0-вариант может быть представлен не одним, а несколькими мутантными формами.
При изучении рестриктного полиморфизма 5-нетранслируемого участка гена РОВ выявлено у Г-варианта 5 подвариантов. М-вариант у холмогорского скота не имеет сайтов рестрикции ни по одной из использованных рестриктаз.
| fo} O18 Е ЗЕ |= SLO ЕЕ а x | >| | а | rns | ey | S ыыы N ь N]w 338 5 ЗЫЗЕ т 71S a nr ry | 5 8 Е я a | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| _ | + | Е хх 5 © | |||||||||||||||||||
| № | EIS | + | >| | Sig Sis 89 | |||||||||||||||||
| ~~ a | +| | |+|+|+| | |+ | +|+|+1+|+ | |+ | |+ | ЕЕ B/S Sir [=ЦЕ | ||||||||||||||
| ~ | +| | |+|+|+| | |+ | +| | |+|+|+|+ | о| | 8 218 | ||||||||||||||
| р= 19 | |||||||||||||||||||||
| > | |о | oS alg | |||||||||||||||||||
| aly a “le | aa | +) | f+] | |+ | + | +l+]+/>] | ap SIS ЕЕ | ||||||||||||||
| R 2 | +| | |+| | |+ | +|+ | +|+|+| | 2 | Ele Е x ois | ||||||||||||||
| w ey | + | + | + | + | sol | Ble > [© = В Я ЗЕ | |||||||||||||||
| м ие | +| | |+| | |+ | + | +|+ | Е Еa | |||||||||||||||
| ъ|+ | a © З'|5 | ||||||||||||||||||||
| |— | rey | + | > Е | ЗЕ ole = | |||||||||||||||||
| y | sl | + | +/+ | = 3 | в Я Sls 5 [2 | ||||||||||||||||
| > | + | + | Sis Elz я = 5 |: | ||||||||||||||||||
| > | || | > w EIS | |||||||||||||||||||
| = = | |||||||||||||||||||||
| #9 | |- | Е | |||||||||||||||||||
Таблица 9 Рестрикционный полиморфизм варианта A гена DRB y холмогорской и черно-пестрой пород ( С. С. Соколова, Г.Е Сулимова,
1993
| Подвариант | ||
|---|---|---|
| Е ООО | ООО СООО | ПО |
| С ОО | ПОС | ИИ |
| ЕТО | tna | ПОО ЗОО |
| ООС | tg | ОО ОИ |
| ПРЕССУ ООО | ПО Те | ОИПОХ ООВ |
| JA(M*+M-H+) | Pag | |
| [Beero Г | 0.46764 | [0,6009 | |
Примечание: М - сайт рестрикции для Мзр [ в 53-м положении; M* — новый сайт рестрикции для Msp I в 37-м положении; Н - сайт рестрикции для Hinf1 в 70-м положении.
Результаты исследований показывают, что полиморфизм ДНК генов BoLA высок. Даже в пределах одного гена количество вариантов и подвариантов могут исчисляться сотнями, т.к. с увеличением количества рестриктаз и при условии изучения всех
Таблица 10. Соотношение частот полиморфных вариантов и подвариантов 5'-нетранслируемой области гена ООВ у животных холмогорской и черно-пестрой пород (по С.С.Соколовой, Г.Е. Сулимовой, 1993).
| рода | рода. | ||
|---|---|---|---|
| ан | | | 02“ | | |
| 1-зариаит | |||
| (149 nat.) | LAr) | [008s | |
| = (156 | С | ОО | ОИ |
| (149+156 п.н. | п.н.)У | | = | |
| fe амплификации Примечание: Al+ — | | сайт рестрикции для | = Alu I в 73-м положении | ОИ от 5’-конца ам- |
плифированного фрагмента; H+ - сайт рестрикции для Hinf1 в 47-м нуклеотиде; Н*+ ~ новый сайт рестрикции для Hinf1 в 71-м положении; (+) - наличие, (-) — отсутствие сайта рестрикции; (+) - одновременное присутствие обоих подвариантов.
