Таблица 9 Рестрикционный полиморфизм варианта A гена DRB y холмогорской и черно-пестрой пород ( С. С. Соколова, Г.Е Сулимова,
1993
| Подвариант | ||
|---|---|---|
| Е ООО | ООО СООО | ПО |
| С ОО | ПОС | ИИ |
| ЕТО | tna | ПОО ЗОО |
| ООС | tg | ОО ОИ |
| ПРЕССУ ООО | ПО Те | ОИПОХ ООВ |
| JA(M*+M-H+) | Pag | |
| [Beero Г | 0.46764 | [0,6009 | |
Примечание: М - сайт рестрикции для Мзр [ в 53-м положении; M* — новый сайт рестрикции для Msp I в 37-м положении; Н - сайт рестрикции для Hinf1 в 70-м положении.
Результаты исследований показывают, что полиморфизм ДНК генов BoLA высок. Даже в пределах одного гена количество вариантов и подвариантов могут исчисляться сотнями, т.к. с увеличением количества рестриктаз и при условии изучения всех
Таблица 10. Соотношение частот полиморфных вариантов и подвариантов 5'-нетранслируемой области гена ООВ у животных холмогорской и черно-пестрой пород (по С.С.Соколовой, Г.Е. Сулимовой, 1993).
| рода | рода. | ||
|---|---|---|---|
| ан | | | 02“ | | |
| 1-зариаит | |||
| (149 nat.) | LAr) | [008s | |
| = (156 | С | ОО | ОИ |
| (149+156 п.н. | п.н.)У | | = | |
| fe амплификации Примечание: Al+ — | | сайт рестрикции для | = Alu I в 73-м положении | ОИ от 5’-конца ам- |
плифированного фрагмента; H+ - сайт рестрикции для Hinf1 в 47-м нуклеотиде; Н*+ ~ новый сайт рестрикции для Hinf1 в 71-м положении; (+) - наличие, (-) — отсутствие сайта рестрикции; (+) - одновременное присутствие обоих подвариантов.
доменов, полиморфизм будет возрастать в геометрической про. порции. Необходимо знать, какие полиморфные варианты ДНК изменяют структуру и функцию белка, кодируемого данной последовательностью. Только тогда можно оценить значимость тех или иных вариантов и перспективность их использования в селекции.
Связь BoLA с устойчивостью к болезням
Связь определенных аллелей ГКГС с болезнями изучается очень активно, но, в основном, на уровне лейкоцитарных антигенов. Однако имеется и ряд работ, раскрывающих на молекулярном уровне сложный характер изменений в самой молекуле ДНК.
Установлен факт, показывающий молекулярную основу ассоциации различных гаплотипов с ревматоидным артритом за счет того, что в различных Ь-цепях (кодируемых генами класса II) присутствует общий эпитоп. Применение ПЦР-анализа в сочетании с секвенированием позволило выявить у 83% из обследованной группы больных высококонсервативный эпитоп в Ъ-цепях, кодируемых гаплотипами DR4 и DRI. Два из субтипов DR4 (Dw4 и О\14) ассоциированы с заболеваниями, а два других (Dwl0 и Dw13) нет. Показано, что первые два субтипа несут общий гипервариабильный аллельный участок, локализованныйс 67-й по 74ю позицию последовательности аминокислотных остатков, а два последних имеют значимые замены в этом участке. В DRI третий гипервариабильный аллельный участок отличается от такового у DR4Dw4 и Dwl4 одной молчащей заменой в 71-м положении (B.R. Wordsworth et al., 1989).
Описано существование делеций в центральной части HLA, которые изменяют число копий генов в этом районе в тех гаплотипах, которые наиболее часто ассоциируются с аутоиммунными заболеваниями (K.Tokylada et al., 1989). Вариации числа копий генов в центральной части ГКГС нередко сопровождаются ассоциацией с аутоиммунными заболеваниями у человека, а также могут быть маркерами чувствительности к ретровирусным инфекциям (P.I.Cameron et al., 1988).
Показаны ассоциации с HLA таких инфекций, как вирусного иммунодефицита человека, проказы, туберкулеза, малярии и друГИХ.
У крупного рогатого скота эти исследования начаты в связи с заболеваемостью маститом. Эти работы проводились в ГИЗ "Лесные поляны" на животных холмогорской породы. Оказалось, что фрагменты 320 и 220 61-домена DRB могут служить генетическими маркерами восприимчивости к маститу, т.к. присутствуют только у больных животных. У этих же животных в 3 раза выше частота фрагментов в 76 и 100 п.н. (табл. 11)
Фрагменты получены в четко определенных сочетаниях (генотипах). Чаще встречается генотип A, несущий только фрагмент в 141 п.н. Причем у здоровых животных этот генотип встречается в 2 раза чаще. Варианты (генотипы) В, D и Е возможно, ассоциируют с восприимчивостью к маститу, т.к. были обнаружены только в группе больных животных. Вариант С был только у здоровых коров.
При рестриктном анализе варианта А корреляции подвариантов с устойчивостью или восприимчивостью к маститу не выявлено.
Таблица 11. Частота продуктов амплификации Ь1-домена гена ОВВ у больных маститом и здоровых коров ( С.С. Соколова, Г.Е Сулимова, 1993
| Размер фрагмента | Частота | фрагмента, % |
|---|---|---|
| здоровые животные | ||
| 320-316 | ||
| 280-278 | ||
| | 220-216 | 020 | 035 |
| В005 ТОО ПОХ ОИ | 035 | |
| ОТ ТОНИ0850.95 ПО ОИ | 035 | |
| ПТИ ПОС СООО | 0,60 | |
| 00| | ||
В группе здоровых и больных маститом коров был проведен И анализ 5'-нетранслируемой области гена ООВ. По частоте ос-
