Результаты анализа гена В LAD методом ПЦР - ПДРФ
Амплификаты из ядерной ДНК должны представлять собой полосу длиной 132 п.н.
После рестрикции полученных амплификатов на электрофореграмме должна наблюдаться следующая картина:
| Аллели | Фрагменты TaqI | рестрикции (п.н.) НаеШ |
|---|---|---|
| NN | 71,61 | 87, 45 |
| NB | 132, 71,61 | 87, 6 8 , 45, 19 |
| ВВ | 132 | 6 8 , 45, 19 |
Животные, гомозиготные по нормальному аллелю гена BLAD, имеют генотип NN (нормальный аллель обозначают как N). Они здоровы и не являются носителями мутации.
Появление дополнительных сайтов рестрикции и, соответственно, появление дополнительных фрагментов ДНК на электрофорезном геле свидетельствует о том, что в результате точковой мутации произошла замена основания А — аденина на основание G — гуанин в гене, ответственном за проявление BLAD-синдрома. Мутантный аллель обозначается как В.
У гетерозиготной особи в геноме присутствуют два аллеля гена BLAD, один — поврежденный мутацией (В), другой — не поврежденный (N). Это генотип NB. Фенотипически такие животные являются здоровыми, но несут в своем генотипе рецессивный мутантный аллель.
Животные с двумя мутантными аллелями (генотип ВВ) являются носителями мутации и неизлечимо больны.
Необходимое оборудование
-
Низкоскоростная центрифуга с охлаждением.
-
Микроцентрифуга типа «Эппендорф».
-
Термостат.
-
Прибор для горизонтального гель-электрофореза с источником постоянного тока, кювета для формирования агарозного геля, гребенки для формирования лунок в геле, подложки для геля.
-
Трансиллюминатор с фотоаппаратом или видеокамерой.
-
6 . Морозильник (-20°С).
- Электрическая плитка.
8 . Бидистиллятор.
-
Весы технические до 500 г.
-
pH-метр или универсальная индикаторная бумага.
11 • Аппарат для перегонки фенола (круглодонная колба с тремя шлифами, суховоздушный холодильник, асбест для изоляции холодильника, электрическая плитка).
-
ДНК — амплификатор (термоциклер).
-
Пробирки типа «Эппендорф» на 1,5 мл и 0,5 мл.
- Вариационные пипетки 0,5-10 мкл, 5-40 , 40-200 , 100-
1 0 0 0 мкл.
-
Мерные колбы на 2, 1 0,5 л, мерные стаканы на 1 л, 0,5 л, цилиндры мерные 100 мл, пипетки на 1 5, 10 мл.
-
Перчатки резиновые.
Нормы
Производительность труда по данной методике составит
50 проб в месяц на одного сотрудника лаборатории.
5. Цитогенетический метод выявления аномалий у крупного рогатого скота
Позволяет выявить численные нарушения кариотипа и хромосомные перестройки у аномальных потомков и их родителей.
Для предотвращения распространения вредных аберраций, повреждений хромосом необходим систематический контроль (мониторинг) за состоянием кариотипов у основной воспроизводящей части популяций.
Изучение кариотипа у аномальных животных и их родителей проводят для обнаружения хромосомных и геномных мутаций, структурных изменений хромосом и количественных изменений кариотипа как причины фенотипических аномалий.
5.1. Необходимые материалы
-
Питательные среды для культивирования лейкоцитов (игла, N 199, RPMI 1640 или их смесь).
-
Реактивы.
Реактивы
-
Митогены (фитогемагглютинин, Concanavalin А).
-
2 . Гепарин.
-
КС1.
-
Метиловый или этиловый спирт.
-
5 . Ледяная уксусная кислота.
-
6 . Антибиотики (пеницилин и стрептомицин).
-
Красители азур и эозин (краситель Романовсного).
-
8 . Краситель Гимза.
-
Краситель акридиновый оранжевый.
5.2. Правила получения и хранения биологического материала для цитогенетического анализа
Биологическим материалом для проведения цитогенетического анализа служат лейкоциты и лимфоциты периферической крови. Общим правилом взятия биологического материала является обязательное соблюдение стерильности при взятии крови.
Взятие и доставка образцов крови
Периферическая венозная кровь в количестве 5-10 мл забирается в стерильный одноразовый шприц и переносится в стерильную пробирку или флакон с 0 , 05 - 0,1 мл стандартного раствора гепарина (5000 ЕИ в 1 мл). У крупного рогатого скота кровь берется стерильной одноразовой системой во флакон из яремной вены.
Перед взятием крови поверхность кожи в месте введения иглы стерилизуют 70%-ным спиртом. Вся процедура взятия крови должна быть проведена с максимальным соблюдением стерильности.
Образцы крови помещают в сумку-холодильник или термос при температуре 2-4°С и направляют в лабораторию в течение 1-2 ч с момента взятия биологического материала.
К образцам прилагается ведомость с указанием даты взятия крови, клички, индивидуального номера животного, родителей, возраста, породы.
